海战中的威胁主要来自于天空与海底，天空威胁主要是各类战斗机，海底则是潜水艇。第二次世界大战潜水艇的应用并不多，但潜水艇的作用还是非常大的，有时候能够起到关键性的作用，比较有代表性的是美军潜艇对日本海军造成的致命打击。
美国的主力潜水艇
美国舰队的潜艇早期发展总体而言是优于其它国家的，这得益于他们在雷达和声呐设备方面的优势，类似“小鲨鱼”、“白鱼”级和“丁鲷”级别的潜艇都有着吨的标准，设计方面也是非常不错的，比较欠缺的一点是其配备的鱼雷在战争中相对而言是比较低质的，但是这也已经不重要了，因为日本在反潜艇作战方面的能力实在是太弱了，并且美国的策略是截断日本的海上运输线，对攻击日本的这些海上运输船来说，这些潜水艇就够了。
日本的主力潜水艇
日本的潜水艇能力并不突出，虽然他们曾建造过标准达吨的I-级别的大型潜艇，但他们更多的标准潜艇缺点和优点一样明显，缺点就是下潜速度慢并且下潜深度有限，优势是携带的鱼雷非常先进，就是毫米口径的“长矛”鱼雷弹。他们用这种鱼雷弹击沉过美军航母“黄蜂”号和“约克镇”号。
英国的主力潜水艇
二战期间，英国的潜水艇主要有三种级别，U型、S型和T型。吨标准的U型艇原本在设计上是用来满足训练任务的，但在地中海战役中却意外起到了很好的作用，因为他们的体型、快速潜水和运载鱼雷发射管等重型武器装备的功能非常适合地中海特定的水域。
英国的T型艇体积更大，可以携带八枚鱼雷，这比其他国家的携带量都要高一些。
德国的主力潜水艇
德国的U艇部队主要配备2种类型，一种吨的小型7号潜艇，一种是吨的中型9号潜艇。战争初期，德国人的U艇实力是非常强悍的，立下过赫赫战功，后期随着战事的发展逐渐被盟军的反潜艇部队所超越，为止德国进一步升级潜艇的下潜速度与攻击能力，少数的20号和23号德国潜艇被开发出来投入战斗，奈何时效大差，服役的实在太晚，并没有避免大西洋战争中艘U艇战败的结局。
第二次世界大战，潜水艇直接对抗的情况并不多，各国的潜水作战以及反潜艇作战的能力相差也并不大。
美国之所以能够快速战胜日本，潜水艇的确起了非常重要的作用，但并不是因为其在性能上有多强悍，而是在于美军策略上的胜利，不是以攻击敌舰为主要目标，而是以攻击敌方的运输船为主要目标，切断敌军的运输线，而日本恰恰忽略了这一点，最终也是难逃失败的命运。
德国的U艇从领先到落败也是受制于海上运输线被封锁，建造武器的各种资源与材料进不来，战争损耗的补给无法第一时间完成所造成，当然这是失败的客观原因，最主观的原因还是反人类的不正义战争最终也是必然会以失败告终的。